Единственная папка, которую надо указать - это папка, куда установлен симулятор. Дальше утилита все сделает сама.
Если каких-то аэропортов, которые у тебя установлены (естественно, они должны быть правильно установлены
), нет в списке - значит для них не требуется добавлять/изменять данные.